ポール動物病院ではペットとして一般的ではない動物も診察する。ドクター・ポールはどんな動物でも平等に受け入れ治療するからだ。そのため門前払いを受けた飼い主たちがドクター・ポールを頼って来院する。脚を引きずっているアヒルやデキモノのあるトカゲ、さらには珍しいキツネなど、犬と猫だけで収まらない。チーム・ポールは経験と知識をフル活用して珍しい動物たちの命を救う。
ポール動物病院では犬と猫だけではなく鳥も治療する。脚を痛めたニワトリや、羽根が抜けてしまったインコ、驚くほど長生きしているハトがやって来る。ドクター・ポールはどんな鳥にも寄り添い、丁寧に治療する。一方でチャールズはエミューを引き取ることになる。思わぬきっかけで、エミューを家族の一員に加えることになるポール一家。ドクター・ポールとチャールズは受け入れ態勢を整える。
ポール動物病院では予測しない事態が度々起こる。毎日が波乱万丈でどんな動物がどんなケースを抱えてくるか分からない。危険な病気が疑われる生まれたばかりのヤギや、原因不明の咳が続く馬、呼吸がままならない状態の猫。そしてなぜかお尻の羽が抜けてしまったニワトリも。経験豊富なドクター・ポールでさえ、見たことのないケースばかり。しかしどんな状況でも、ドクター・ポールたちはあきらめない。何とかして解決策を探す。
ミシガン州の冬は大雪に見舞われる。たとえ雪が積もっても、ドクター・ポールは動物の命を最優先し往診に向かう。そして雪の中で寒さに耐えながら妊娠検査をする。冬の間は雪による事故も発生する。クリニックには車にひかれた犬が運び込まれる。暖かくなっても、クリニックの忙しさは変わらない。春は出産シーズンとなり、ドクター・ブレンダは難産の牛の分娩介助に出かける。果たして子牛を無事に救えるのだろうか。
ポール動物病院のスタッフはみんな動物好き。各々がいろんなペットを飼っている。元スタッフはお尻が奇妙に膨れた犬を連れてくる。ドクター・エミリーは迷い犬と一緒に出勤。診察すると多くの問題が見つかる。そして動物管理局の依頼で保護されたセント・バーナードを診察することになったドクター・ポールは、ひと目で気に入る。スタッフのクリステンが連れてきた飼い猫は、脚に重傷を負っていることが判明する。
ポール動物病院は動物のために24時間365日対応している。そのためドクター・ポールたちにゆっくり休んでいる暇はない。緊急の電話が入るとすぐに往診に向かったり、クリニックで治療したりと大忙し。夜の受診で最も多いのが犬同士によるケンカ。大型犬2匹に襲われた小さな犬がやってくる。体の至るところに噛み傷のある犬をドクター・エミリーが治療する。ドクター・ニコールはヤギの難産の連絡を受け、農場へ向かう。
ポール動物病院には様々な動物が訪れるが、特に犬はスタッフに人気。子犬のかわいさに、みんなメロメロになってしまう。グッタリして元気のない子犬が来院。ドクター・ニコールは原因を突き止め、付きっきりで治療にあたる。ドクター・エミリーはフラついてまともに歩けない犬を診察。何らかの中毒を疑う。ドクター・ポールのもとには脱臼した犬がやってくる。重度の脱臼だと判明するが、犬は再び歩けるようになるのか。
ポール動物病院には複数の獣医師が勤務している。その良さは、困難なケースに直面した時にお互い助け合えること。ドクター・ポール、ドクター・ブレンダ、ドクター・エミリー、ドクター・ニコールを中心に、スタッフが加わって強力なチームが結成される。そんなクリニックに、経験豊富なドクター・ポールでも見たこともない問題を抱えた牛がやってくる。なんと「6本脚」なのだ。チーム・ポールは協力して解決策を探す。
ポール動物病院には次々と動物が訪れ、ドクター・ポールたちは大忙し。そんな中、新人ドクターがチーム・ポールに加わる。大学を卒業したばかりの彼らをドクター・ポールたちが育てていく。診察や往診を一緒に行い、ドクター・ポールの流儀を目で見て覚えてもらうのだ。難産に苦しむ牛や、倒れて起き上がれない馬。そしてヤマアラシに襲われた犬も。新人ドクターは現場で様々な経験をして、一人前に育っていく。
どんな動物の赤ちゃんでも、そのかわいさにみんなメロメロ。ポール動物病院には様々な問題を抱えた赤ちゃんが次々と訪れる。しかも犬や猫だけではない。ドクター・エミリーは、生後間もないトナカイの赤ちゃんを診察する。グッタリしているトナカイは元気を取り戻せるのか。ドクター・ブレンダのもとには出血の止まらないアルパカの赤ちゃんがやってくる。そしてドクター・ポールは大好きなミニチュアホースを診察する。
今回の特別編では子猫にスポットを当てる。子猫は好奇心旺盛でやんちゃ。いたずらをしても、そのかわいさですべて許してしまう。ポール動物病院には飼い猫や納屋にすむ猫、そして野良猫まで様々な猫がやってくる。チャールズがネズミ対策で飼い始めた猫は治療を受けたものの、再び調子を崩す。ドクター・ポールはどんな方法で治すのか。一方、ドクター・ブレンダは交通事故に遭った子猫を診察する。
どんな動物でも診察するドクター・ポールだが、ポール動物病院に来ることのできない動物もいる。そんな時にはドクター・ポールが車を走らせ、往診に向かう。往診で重要なのは農家との連携。特に牛や馬が緊急事態に陥った場合は、一刻も早く処置をしなければならない。ドクター・ポールは喉を詰まらせ呼吸もままならない馬のもとへ急ぐ。一方、ドクター・エミリーは膣脱を起こしてしまった牛がいると聞き、農場で処置を行う。
ポール動物病院の獣医師たちは日々、動物のために奔走している。ドクター・ポールたちの努力も苦労も想像以上だが動物の命を救うことで、すべてが報われる。クリニックに頭に矢の刺さった猫が来院する。絶望的な状況だがドクター・ポールは無事に猫を助けられるだろうか。ドクター・ニコールは胸に穴が開いた馬の治療を行う。傷の深刻度が分からない中、ドクター・ニコールは回復を願い馬に生きるチャンスを与える。