『スゴ腕どうぶつドクター』でお馴染みのドクター・ポールと息子のチャールズ。スピンオフではチャールズがドクター・ポールの思いを受け継ぎ、ファミリー農場をイチから作る。広大な土地をいかにして農場に作り変えるのか。チャールズは義兄弟のベンも巻き込み家族で力を合わせて、まずは種蒔きに臨む。そしてポール家に新たな仲間が。チャールズは農場で牧羊犬として飼うグレート・ピレニーズをクリニックへ迎えに行く。
農場作りは種蒔きからと張り切ったチャールズとベン。しかし、トラクターがぬかるみにはまって立ち往生。作付けが遅れると家畜の干し草の収穫がままならない。そこで水溜まりを掘り返してみると…。一方、ベスは養蜂農家を目指してミツバチの巣箱作りに励み、翌日には５万匹のハチを車に乗せて帰って来る。物知りドクター・ポールが牧草地とミツバチの生態を分かりやすく解説。トラブルを乗り越えていよいよスタート！
夏を迎え、最も過酷と言われる干し草作りが行われる。第一段階である牧草の刈り取りからトラブル発生。チャールズはドクター・ポールとベンとともに悪戦苦闘する。さらには大雨に見舞われ、刈り取った牧草がビショビショに濡れてしまう。無事に作業を終えることができるのか。一方農場には新しい仲間が増える。アビゲイルのためにエミューを探しに行くチャールズ。１羽の予定が、アビゲイルの希望で３羽連れて帰ることに。
ミシガンにカウンティ・フェアの季節到来！農場のヒツジと牛を競売で購入することになり、チャールズとベンは牧草地のフェンス作りに取り掛かる。たかがフェンスと思いきや、様子を見に来たドクター・ポールから脱走が得意なヒツジの話を聞いて、やり直しの危機に！一方、ヤギのノノを可愛がっているベスはもう一頭欲しくなり競売で買うことにする。ところが、ヤギを厄介者扱いするドクター・ポールから思わぬ「待った」がかかる。
農場にやってくる羊のために、チャールズとベンは羊小屋作りに挑む。チャールズはアメリカではあまり見られないような外観と機能を備えた羊小屋を計画していた。果たして構想通りの小屋が完成するのか。そしていよいよ羊の競売へ。チャールズは６匹購入する予定だが、動物の落札価格が例年の何倍にも高騰していた。しかも希望するメスの数が少ないことが分かり、チャールズたちは思わぬ危機に直面する。
ファミリー農場に動物たちがやって来る！カウンティ・フェアの競売でヒツジと牛を落札しようと意気込むチャールズはすっかり熱くなって入札に夢中。予算オーバーが心配なベス。勢いに飲まれて自分も牛を買いたくなったベン。農場では動物の到着までに完成しなければならないヒツジ小屋の工事が急ピッチで進む。一方ミツバチの世話係になったベスは巣箱の中の様子がおかしいことに気付く。そして残るはエミューの新居への引っ越し！
農場には納屋が必要！チャールズはかつてない大プロジェクトに挑む。彼が目をつけたのは築100年以上の古い納屋だった。そこはかつてドクター・ポールが牛の世話をするために通った場所だ。建築上の傑作であり、歴史がたくさん詰まった納屋。それを解体し、自分の農場で復元するためには緻密な計画と、慎重な作業が必要だった。チャールズはベンと協力し、仲間の力も借りて、危険の伴う解体をいよいよスタートさせる。
築100年の納屋をファミリー農場へ移動するため、慎重に解体を進めるベンとチャールズ。昔ながらの木製留めくぎを一本ずつ抜きながら徐々に不安定になっていく納屋の骨格で作業を続けるふたり。そしてベンが作業用リフトへ移ろうとしたその瞬間…！一方ベスは牧羊犬として飼い始めたグレート・ピレニーズの子犬クロヴィスの訓練を始める。ヤギのノーノーの邪魔も入ってなかなか集中できないある日、農場から姿を消してしまう。
一応完成した羊小屋。しかしチャールズもベンも予想しなかった展開が待っていた。なんと牛と羊のオシッコでドロドロになったのだ。経験豊かなドクター・ポールの力を借りて羊小屋の構造を見直し、２人は大改修を行う。同じ工程を繰り返すはめになったチャールズとベンだが、フェアでアビゲイルがひと目惚れした羊が農場にやってくる前に、羊小屋を一新させなければならない。新しくなった羊小屋はうまく機能するのか。
"農場にベスの夢のガーデンを作ることにしたチャールズ。造園のプロであるベンが設計を担当、大喜びのベスと工事の準備に取り掛かる。そこへ現れたチャールズは子ども時代から愛着を持っている庭の石を使って滝を作ると言い出し、ベンとともにドクター・ポールのキャビンへ石の採集に向かう。暴風雨が迫る中、懸命に働くベンの姿をみたベスは、弟を励ますためにあるアイディアを思いつく。やがて、ずぶ濡れになったベンは…。
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チャールズは初めての冬の到来を前に準備を怠らない。牧草地周りのフェンスをチェックし修理を施す。そしてベスのためにガーデンを完成すべくベンと作業を急ぐ。池と滝が出来上がり、あとはガーデニングスペースを残すのみだ。果たしてベスの希望通りのガーデンに仕上がるのか。一方ベスはミツバチが冬を無事に越せるよう専門家の助けを借りる。しかし心配していた通り、ミツバチの巣箱から深刻な問題が見つかる。
農場に冬将軍到来！チャールズはヒツジの群れに上質のウールで知られるメリノ種を加えることにする。春に出産を予定している新入りのヒツジのために小屋を整え、毛を刈る準備を進めるチャールズとベン。一方、ベスは元気のないミツバチが無事に冬を越せるように巣箱を風から守り、春の訪れを待って群れの様子を確認に行く。ドクター・ポールの知恵を借りながら、動物とともに寒さを凌いだささやかな農場にやがて春の息吹が！
出産を控えた羊の毛刈りを試みるチャールズだが、羊が一向に捕まらない。そこへドクター・ポールの救いの手が。チャールズたちは無事に羊を捕まえてうまく毛を刈れるのか。そんな中、チャールズが往診先で大ケガを負い、数ヵ月の安静を強いられてしまう。一年で最も忙しい農家の春をベスはチャールズなしで乗り切らなければならない。力を合わせるベスとベン。そしていよいよ羊の赤ちゃんを農場に迎える準備に入る。
チャールズのケガで大忙し！無事に冬を越して元気いっぱいのミツバチの世話に忙しいベスが動物たちの世話も引き受けて大奮闘。農場で初めて生まれた子ヒツジのロミオが可愛くて堪らない。一方、ヒツジ小屋の水はけ問題で究極の解決策を思い付いたベンはドクター・ポールの元へ相談に行く。やがて、ガーデンの植え付けの日が訪れ、ファミリー大集合！チームワークで問題を乗り切ってきた涙と笑いの農場の一年を振り返る。
